Causas del SIBO: por qué aparece y por qué recae el sobrecrecimiento bacteriano

Tratar el SIBO sin saber por qué apareció es como achicar agua sin tapar la vía por la que entra. Repaso las causas más habituales del sobrecrecimiento bacteriano, para que sepas qué preguntar en tu próxima consulta.

Cómo se relacionan las causas con el tipo de gas

No he encontrado estudios que relacionen cada causa de fondo con un gas concreto. Lo que sí se ha visto es que, en el SII, las pruebas de aliento con metano positivo son más frecuentes en el SII con estreñimiento que en el SII con diarrea (OR 2,3) ¹.

El diagnóstico se hace con el test de aliento con lactulosa o glucosa, que mide hidrógeno y metano. Los síntomas son bastante parecidos entre unas causas y otras y, según el consenso norteamericano sobre pruebas de aliento, la historia clínica por sí sola no suele permitir distinguir el SIBO de otras afecciones con síntomas similares ².

Por qué aparece el SIBO, en corto

El SIBO (sobrecrecimiento bacteriano en el intestino delgado, o Small Intestinal Bacterial Overgrowth en inglés) es un aumento de las bacterias del intestino delgado por encima de lo normal. Eso sí, las pruebas con las que se diagnostica tienen una sensibilidad y una especificidad limitadas ¹.

Las causas se agrupan en unos pocos mecanismos, y conviene revisarlos con tu médico en vez de quedarte solo con el nombre del diagnóstico.

Poco ácido gástrico

Lo que más respaldo tiene en este grupo es el uso de inhibidores de la bomba de protones (IBP), los fármacos para el reflujo que reducen el ácido del estómago. En un metaanálisis de 29 estudios, el SIBO fue más frecuente en quienes los tomaban (36,8 % frente a 19,9 %; OR 2,14) y el riesgo aumentó con la duración del tratamiento, aunque hubo mucha heterogeneidad entre estudios ³. Otro metaanálisis encontró un aumento moderado del riesgo (OR 1,71) ⁴. El riesgo de SIBO también aumenta con la edad ⁵.

Ojo: si tomas un IBP, no lo dejes por tu cuenta. Habla antes con tu médico.

Motilidad intestinal lenta

El SIBO suele acompañarse de un tránsito intestinal lento, que reduce la eliminación normal de bacterias del intestino delgado. Ese enlentecimiento puede deberse a trastornos de la motilidad, a la neuropatía autonómica de la diabetes o a una menor acción estimulante de las hormonas tiroideas ⁵. El SIBO se ha asociado a la diabetes, al hipotiroidismo y a la esclerodermia.

Por eso se usan procinéticos en el tratamiento del SIBO, aunque no he encontrado estudios que demuestren que eviten las recaídas.

Alteraciones estructurales

Se ha descrito SIBO después de la cirugía bariátrica y de la gastrectomía ⁶. En la enfermedad de Crohn, haber tenido una cirugía intestinal previa (OR 2,38), sobre todo si se reseca la válvula ileocecal, y la enfermedad fibroestenosante (OR 7,47) aumentaron las probabilidades de SIBO ⁷. En el síndrome de intestino corto, la pérdida de la válvula ileocecal, la dismotilidad y la supresión del ácido aumentan el riesgo ⁸.

Enfermedades de base

Entre las enfermedades asociadas al SIBO se describen la enfermedad de Crohn, la celiaquía, la diabetes, el hipotiroidismo, la esclerodermia y el síndrome del intestino irritable ⁵. En la enfermedad inflamatoria intestinal, el SIBO apareció en el 22,3 % de los pacientes (OR 9,5 frente a los controles) ⁷. En el SII la asociación es menor (OR 3,7) y la calidad de la evidencia es baja ¹. Una asociación no implica que una enfermedad cause la otra.

Dieta y otros factores

No he encontrado estudios que demuestren que la dieta cause el SIBO. En una revisión, el SIBO se asoció con el tabaquismo, además de con la edad ⁵.

¿Por qué vuelve el SIBO después del tratamiento?

Esta es, de lejos, la pregunta que más me he hecho yo por mucho tiempo. En un estudio con 80 pacientes tratados con rifaximina, la prueba de aliento volvió a ser positiva en el 12,6 % a los 3 meses, en el 27,5 % a los 6 y en el 43,7 % a los 9 ⁹. La edad, la apendicectomía previa y el uso crónico de IBP se asociaron con la recaída. La AGA recomienda identificar y corregir las causas cuando sea posible ¹⁰.

Por eso el diagnóstico debería ir siempre acompañado de una pregunta más: «¿Y por qué ha aparecido esto en mi caso?», no solo confirmar el positivo y tratar.

¿Qué alimentos provocan el SIBO?

No he encontrado estudios que demuestren que algún alimento provoque el SIBO. Una revisión sistemática de guías, de 2026, concluye que la evidencia es insuficiente para respaldar que la dieta elimine el SIBO, aunque puede ser útil junto con otras terapias ¹¹. Por eso la dieta se usa como apoyo, no como tratamiento único, algo que ya expliqué con un menú semanal concreto.

¿Qué consecuencias tiene el SIBO si no se trata la causa?

Según la AGA, en los casos más graves puede haber esteatorrea, es decir, grasa en las heces, y en los análisis puede aparecer el ácido fólico elevado y, con menos frecuencia, déficit de vitamina B12 u otras carencias nutricionales ¹⁰. La AGA también advierte de los riesgos del tratamiento prolongado con antibióticos de amplio espectro, algo a tener en cuenta si se repiten ciclos sin un resultado duradero.

Resumiendo un poco

El SIBO se asocia a varios factores: el uso de inhibidores de la bomba de protones, un tránsito intestinal lento, cirugías previas y enfermedades de base como Crohn, diabetes o hipotiroidismo. La recaída es frecuente: en un estudio, la prueba volvió a dar positivo en el 43,7 % a los 9 meses. Si ya has hecho un tratamiento y el SIBO ha vuelto, antes de repetir el mismo ciclo, vale la pena preguntar expresamente por la causa, no solo por el antibiótico.

Referencias

1. Shah A, et al. Small intestinal bacterial overgrowth in irritable bowel syndrome: a systematic review and meta-analysis of case-control studies. Am J Gastroenterol. 2020;115(2):190-201.[↩][↩][↩]
2. Rezaie A, et al. Hydrogen and Methane-Based Breath Testing in Gastrointestinal Disorders: The North American Consensus. Am J Gastroenterol. 2017;112(5):775-784.[↩]
3. Khurmatullina AR, et al. The Duration of Proton Pump Inhibitor Therapy and the Risk of Small Intestinal Bacterial Overgrowth: A Systematic Review and Meta-Analysis. J Clin Med. 2025;14(13):4702.[↩]
4. Su T, et al. Meta-analysis: proton pump inhibitors moderately increase the risk of small intestinal bacterial overgrowth. J Gastroenterol. 2018;53(1):27-36.[↩]
5. Efremova I, Maslennikov R, Poluektova E, et al. Epidemiology of small intestinal bacterial overgrowth. World J Gastroenterol. 2023;29(22):3400-3421.[↩][↩][↩][↩]
6. Maslennikov R, Agarkova V, Poluektova E, et al. Treatment of Small Intestinal Bacterial Overgrowth (SIBO) in Gastrointestinal, Hepatic, Endocrine, Neurological, and Postoperative Diseases: A Comprehensive Narrative Review. Med Sci (Basel). 2026;14(2):300.[↩]
7. Shah A, Morrison M, Burger D, et al. Systematic review with meta-analysis: the prevalence of small intestinal bacterial overgrowth in inflammatory bowel disease. Aliment Pharmacol Ther. 2019;49(6):624-635.[↩][↩]
8. Johnson E, Vu L, Matarese LE. Bacteria, Bones, and Stones: Managing Complications of Short Bowel Syndrome. Nutr Clin Pract. 2018;33(4):454-466.[↩]
9. Lauritano EC, et al. Small intestinal bacterial overgrowth recurrence after antibiotic therapy. Am J Gastroenterol. 2008;103(8):2031-2035.[↩]
10. Quigley EMM, Murray JA, Pimentel M. AGA Clinical Practice Update on Small Intestinal Bacterial Overgrowth: Expert Review. Gastroenterology. 2020;159(4):1526-1532.[↩][↩]
11. Jodkiewicz M, Malinowska J, Marek-Woźny K. Global perspectives on dietary management of small intestinal bacterial overgrowth (SIBO): a systematic review of clinical guidelines, consensus statements and expert recommendations. Front Med (Lausanne). 2026;13:1952995.[↩]